Csak állomány szinten törölted, vagy rendes moduleltávolítás volt? Ha a Modulok --> Tevékenységek kezelése (admin felületen) nem törlöd a modult, az adatbázisban megmaradnak a hozzá tartozó táblák, s azokat kézzel kell törölgetni.
Egyébként melyik Certificate modult használod (több is van)? Mi honosítottuk az egyszerű Certificate modult, s néhány apró változtatást eszközöltünk, hogy a magyar felhasználóknak „feküdjön”.