Nehezen, de megtaláltam a megoldást, mert a beállítás nem várt mélységben volt elrejtve a Kezdőoldal -> Portálkezelés -> Segédprogramok -> Tevékenységmodulok -> Feladat -> Leadás segédprogramjai -> Leadás állományban oldalon. Itt volt a listából a 20MB kiválasztva a Portál feltöltési korlátja helyett (ami korábban szintén 20MB volt) és ezért volt meg kurzusszinten az 50MB, feladatszinten meg csak a 20.